RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCM6Q14566 821 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NACC1Q96RE7 527 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNM3Q9UQ16 869 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRIN2DO15399 1336 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HBP1O60381 514 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STBD1O95210 358 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LIG1P18858 919 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYKP43405 635 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2HP62256 183 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HYIQ5T013 277 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAEAQ7L5Y9 396 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STAMQ92783 540 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOD1Q9Y239 953 aa16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLA2G4BP0C869 781 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HIC1Q14526 733 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAD54LQ92698 747 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EVPLQ92817 2033 aa16.21■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALPK3Q96L96 1907 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LYPLA2O95372 231 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EYA4O95677 639 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MUTP22033 750 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCM4P33991 863 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RARRES1P49788 294 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM60Q495X7 471 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPBP1Q86WP2 473 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METTL13Q8N6R0 699 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLD4Q9HCU8 107 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKEF1Q9NU02 776 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STK17AQ9UEE5 414 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HPSEQ9Y251 543 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COL1A2P08123 1366 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB42B2RXF5 422 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARVCFO00192 962 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TREHO43280 583 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC26A4O43511 780 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR1I2O75469 434 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLRC1P26715 233 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AFMP43652 599 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLCN3P51790 818 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EMC2Q15006 297 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 E2F4Q16254 413 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PADI6Q6TGC4 694 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IQUBQ8NA54 791 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NRCAMQ92823 1304 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYH11P35749 1972 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 B4GALT4O60513 344 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPN15O75808 1086 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF202O95125 648 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C22orf31O95567 290 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP2C9P11712 490 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COL6A1P12109 1028 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CASP1P29466 404 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTP1P59025 263 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTGISQ16647 500 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LONRF3Q496Y0 759 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SV2BQ7L1I2 683 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DYMQ7RTS9 669 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNNM3Q8NE01 707 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms