RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 MYBP10242 640 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GYS1P13807 737 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SHMT1P34896 483 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ARSHQ5FYA8 562 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 KSR1Q8IVT5 923 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 VCPKMTQ9H867 229 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GDF11O95390 407 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CASP4P49662 377 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 EPHB4P54760 987 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 RWDD2BP57060 319 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SNCBQ16143 134 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SFR1Q86XK3 245 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CHMP2AO43633 222 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CEP104O60308 925 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 LCA5LO95447 670 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GABPAQ06546 454 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SLF2Q8IX21 1173 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SCLT1Q96NL6 688 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 RAD51CO43502 376 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 UBXN2AP68543 259 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GUCY1A3Q02108 690 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ICA1Q05084 483 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 NNTQ13423 1086 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SLC18A3Q16572 532 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 NAA35Q5VZE5 725 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ANO3Q9BYT9 981 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 113.8
FCHO1-216ENST00000596536 RGL1Q9NZL6 768 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ZBTB39O15060 712 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CETN3O15182 167 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PSMD2Q13200 908 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CFAP58Q5T655 872 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 FAM228AQ86W67 206 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SPDL1Q96EA4 605 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SH3GL2Q99962 352 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 GAKO14976 1311 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 MYH1P12882 1939 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PJA2O43164 708 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 POLD1P28340 1107 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SNX1Q13596 522 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 NAB2Q15742 525 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 IFT20Q8IY31 132 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 REEP2Q9BRK0 252 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 SNHG28P0DPA3 235 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PRLRP16471 622 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 PLS1Q14651 629 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 TAF4BQ92750 862 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 FAM210AQ96ND0 272 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-216ENST00000596536 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.65□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF233A6NK53 670 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ENO4A6NNW6 628 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 AKAP3O75969 853 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 GCNT3O95395 438 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms