RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592253.5

ITGA2B-208, Transcript of integrin subunit alpha 2b, human

TSL 4

Gene ITGA2B, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA2B-208	ENST00000592253	REST	Q13127	1097 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	BECN1	Q14457	450 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	IER5	Q5VY09	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	STBD1	O95210	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	TMOD1	P28289	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRPH	P41219	470 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	MGAT3	Q09327	533 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	ANO5	Q75V66	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	NME8	Q8N427	588 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLITRK3	O94933	977 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CHRNA1	P02708	482 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CXCL10	P02778	98 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	VTN	P04004	478 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	GHR	P10912	638 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	NPEPPS	P55786	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	GPNMB	Q14956	572 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ITGA2B-208	ENST00000592253	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	MED24	O75448	989 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	BMP15	O95972	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	KCNJ6	P48051	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	DNM2	P50570	870 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	SEPT8	Q92599	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZBTB39	O15060	712 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	LYPLA2	O95372	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	RPA1	P27694	616 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	RFC5	P40937	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	IKBKE	Q14164	716 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	PDIA5	Q14554	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	LPIN1	Q14693	890 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	IL17A	Q16552	155 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ITGA2B-208	ENST00000592253	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms