RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591265.1

ZNF554-204, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZNF554, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-204ENST00000591265 BARHL2Q9NY43 387 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PADI3Q9ULW8 664 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 LINC01565O15544 149 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 ITGB1P05556 798 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 NDUFV1P49821 464 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 IGBP1P78318 339 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 COASYQ13057 564 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 STK3Q13188 491 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PCYT2Q99447 389 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 BACH2Q9BYV9 841 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 KAT6AQ92794 2004 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PAK2Q13177 524 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PKN1Q16512 942 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 NFASCO94856 1347 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 C5orf42Q9H799 3197 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 ST18O60284 1047 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 DNAJB1P25685 340 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SLC26A2P50443 739 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SCRN1Q12765 414 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 POF1BQ8WVV4 589 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PHKBQ93100 1093 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 KIF2CQ99661 725 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 CLEC1BQ9P126 229 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 TRPC6Q9Y210 931 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 ESYT2A0FGR8 921 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 FSD2A1L4K1 749 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 DEXIO95424 95 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 STAT5BP51692 787 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 ADCY7P51828 1080 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 UBE3AQ05086 875 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PLCB4Q15147 1175 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 UBE2SQ16763 222 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 MCTP2Q6DN12 878 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SDF4Q9BRK5 362 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 PIEZO1Q92508 2521 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-204ENST00000591265 STK36Q9NRP7 1315 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 SMCO2A6NFE2 343 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 GNA11P29992 359 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 ACTR2P61160 394 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 KRT76Q01546 638 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 BICD2Q8TD16 824 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 GTF3C6Q969F1 213 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 PRRX2Q99811 253 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 TMX1Q9H3N1 280 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 C6orf50Q9HD87 102 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 CSPG5O95196 566 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 ATG7O95352 703 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 ME3Q16798 604 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 ODR4Q5SWX8 454 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 WASF1Q92558 559 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 AAASQ9NRG9 546 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-204ENST00000591265 XBP1P17861 261 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms