RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RESP18Q5W5W9 173 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ATL3Q6DD88 541 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CABP7Q86V35 215 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM50Q86XT4 487 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 RAET1EQ8TD07 263 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX58Q96C10 678 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GPRASP2Q96D09 838 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK15Q96Q40 435 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 POLD4Q9HCU8 107 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMM50Q9Y512 469 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ELP1O95163 1332 aa6.77□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PMD0 336 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA2O43364 376 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BMP15O95972 392 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHA2P01877 340 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CYBAP13498 195 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCG1P19174 1290 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MARK3P27448 753 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPHP41219 470 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP4BP1P59074 171 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTR2P61160 394 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2HP62256 183 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFAIP2Q03169 654 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP1Q07960 439 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LONRF3Q496Y0 759 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ADALQ6DHV7 355 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 JMYQ8N9B5 988 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF511Q8NB15 262 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 AFG1LQ8WV93 481 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FERMT2Q96AC1 680 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM20AQ96MK3 541 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA33Q96N06 139 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PCYT2Q99447 389 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SDF4Q9BRK5 362 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 VTA1Q9NP79 307 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HPSEQ9Y251 543 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR81Q562E7 1941 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQ27 194 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQ64 194 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQD8 194 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX3O15119 743 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAK2O60296 914 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF202O95125 648 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PGK1P00558 417 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 INHAP05111 366 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF286BP0CG31 522 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CMA1P23946 247 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 AFMP43652 599 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R5CQ13362 524 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MCM6Q14566 821 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL4Q14679 1199 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MTFR1Q15390 333 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GNPTABQ3T906 1256 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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