RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	WNT8B	Q93098	351 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	SI	P14410	1827 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CTSH	P09668	335 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ITGB8	P26012	769 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ADAM17	P78536	824 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	XKR9	Q5GH70	373 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ANO5	Q75V66	913 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CEP170P1	Q96L14	293 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WWV3	80 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	RPA1	P27694	616 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	GRIN1	Q05586	938 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SLC39A14	Q15043	492 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	RSPH3	Q86UC2	560 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SCLY	Q96I15	445 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP45	Q9UL16	551 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB39	O15060	712 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SPTLC2	O15270	562 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	STBD1	O95210	358 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	C22orf31	O95567	290 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CKB	P12277	381 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	NPEPPS	P55786	919 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	YEATS4	O95619	227 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	FPGS	Q05932	587 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CABP7	Q86V35	215 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	AK8	Q96MA6	479 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CLIC6	Q96NY7	704 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CSRNP2	Q9H175	543 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CEP290	O15078	2479 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEB2	O15479	319 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	LYPLA2	O95372	231 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SELP	P16109	830 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	UBA7	P41226	1012 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CLCN3	P51790	818 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	KRT85	P78386	507 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SPECC1	Q5M775	1068 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ATL3	Q6DD88	541 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	NACC1	Q96RE7	527 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	PLIN2	Q99541	437 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229		M0QZ92	97 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	CSF2RA	P15509	400 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	TMOD1	P28289	359 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	DDIT3	P35638	169 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	AKT3	Q9Y243	479 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-223	ENST00000584229	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	ECM1	Q16610	540 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CALML4	Q96GE6	196 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MAP7D2	Q96T17	732 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	RSPH10B	P0C881	870 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MUT	P22033	750 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	TXLNA	P40222	546 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	GINS2	Q9Y248	185 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04

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