RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580127.5

MKS1-209, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKS1, Length 843 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-209ENST00000580127 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.35■□□□□ 0.85
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MKS1-209ENST00000580127 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.34■□□□□ 0.85
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MKS1-209ENST00000580127 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.34■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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MKS1-209ENST00000580127 PRRX2Q99811 253 aa20.29■□□□□ 0.84
MKS1-209ENST00000580127 CLEC1BQ9P126 229 aa20.29■□□□□ 0.84
MKS1-209ENST00000580127 C9IYK1 514 aa20.28■□□□□ 0.84
MKS1-209ENST00000580127 FAM86B1E9PN63 330 aa20.28■□□□□ 0.84
MKS1-209ENST00000580127 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.28■□□□□ 0.84
MKS1-209ENST00000580127 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
MKS1-209ENST00000580127 FAM189BP81408 668 aa20.28■□□□□ 0.84
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