RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578571.5

PTPRM-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 1,106 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-207ENST00000578571 TSPAN15O95858 294 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 ASGR2P07307 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 C1QTNF9P0C862 333 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 COL6A2P12110 1019 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 NAT1P18440 290 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 PMLP29590 882 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 TCEA2Q15560 299 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 CHRNA2Q15822 529 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 ALG3Q92685 438 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 CFAP53Q96M91 514 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 JCADQ9P266 1359 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 SSH2Q76I76 1423 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 FYB1O15117 783 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 RFPL3O75679 317 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 CKMP06732 381 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 C8AP07357 584 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 TMEM253P0C7T8 217 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 GNAT1P11488 350 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 ATF2P15336 505 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 ZNF124Q15973 351 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 MIB1Q86YT6 1006 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 CD320Q9NPF0 282 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-207ENST00000578571 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 NFIBO00712 420 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PYGMP11217 842 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SDSP20132 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 NME9Q86XW9 330 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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PTPRM-207ENST00000578571 RNF38Q9H0F5 515 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 MYOTQ9UBF9 498 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 CBLCQ9ULV8 474 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PIK3C2AO00443 1686 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 USP54Q70EL1 1684 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 ALS2Q96Q42 1657 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 CCDC66A2RUB6 948 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 RTL1A6NKG5 1358 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 KRIT1O00522 736 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SLC27A2O14975 620 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 USP19O94966 1318 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 GCP02774 474 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 NCAM1P13591 858 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 MC3RP41968 323 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 AMPHP49418 695 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SSPNQ14714 243 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SHPRHQ149N8 1683 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 SDE2Q6IQ49 451 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 FEZ1Q99689 392 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-207ENST00000578571 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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