RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TAF4BQ92750 862 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TEKT1Q969V4 418 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 FAM161BQ96MY7 647 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 APBA2Q99767 749 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 LZTS2Q9BRK4 669 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 IER2Q9BTL4 223 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 RMI1Q9H9A7 625 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 MRS2Q9HD23 443 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 COPRSQ9NQ92 184 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 KMT5AQ9NQR1 393 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 INTUQ9ULD6 942 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 EID1Q9Y6B2 187 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SHTN1A0MZ66 631 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ENPP3O14638 875 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 FIBPO43427 364 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF623O75123 536 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 TGM1P22735 817 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PSMA3P25788 255 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN7P41732 249 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 ITGA1P56199 1179 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF69Q9UC07 566 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS47A8MTI9 375 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 H0YHG0 523 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 VCAM1P19320 739 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SEPHS1P49903 392 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SESN3P58005 492 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 RBL2Q08999 1139 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TRDNQ13061 729 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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