RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	BDH2	Q9BUT1	245 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	APP	P05067	770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	EPHB4	P54760	987 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CD83	Q01151	205 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	EFEMP1	Q12805	493 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	BORA	Q6PGQ7	559 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	NIM1K	Q8IY84	436 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FEZ1	Q99689	392 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PTPN18	Q99952	460 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084		A0A087X0B3	334 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	B4GALT4	O60513	344 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	HIP1R	O75146	1068 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	KRT37	O76014	449 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CELA3B	P08861	270 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FNTB	P49356	437 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	KIF11	P52732	1056 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PPP2CB	P62714	309 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PPP2CA	P67775	309 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	DSG1	Q02413	1049 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ZNF827	Q17R98	1081 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	KIF18B	Q86Y91	864 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	OR10A5	Q9H207	317 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		5	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	KPNA6	O60684	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CUTA	O60888	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	F2	P00734	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	SLC9A1	P19634	815 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FLT3	P36888	993 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ADCY8	P40145	1251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ETV4	P43268	484 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PLP2	Q04941	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FOXB1	Q99853	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	GPR42	O15529	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PRL	P01236	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	NFKB2	Q00653	900 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	MOGS	Q13724	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	SURF1	Q15526	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	TBR1	Q16650	682 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084		H7C1D1	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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