RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	USP14	P54578	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GPR19	Q15760	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	INF2	Q27J81	1249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452		H7BY64	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TPP1	O14773	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	HRG	P04196	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CYP17A1	P05093	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SYP	P08247	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GNAT1	P11488	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SRF	P11831	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FOSL1	P15407	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	RXRB	P28702	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KIF11	P52732	1056 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TNK2	Q07912	1038 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	STK3	Q13188	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SRL	Q86TD4	932 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	JADE3	Q92613	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MYD88	Q99836	296 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TOM1	O60784	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DTNB	O60941	627 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MYL3	P08590	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KRT15	P19012	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	AGXT	P21549	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ENPP1	P22413	925 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	BCL6	P41182	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	JAM2	P57087	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM193A	P78312	1265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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