RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	RPS6KA5	O75582	802 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	DEXI	O95424	95 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP4A	P20648	1035 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	CIITA	P33076	1130 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	DGKI	O75912	1065 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	BMPR1A	P36894	532 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	TBCK	Q8TEA7	893 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	DENND3	A2RUS2	1198 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	RB1	P06400	928 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	USP11	P51784	963 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	ODR4	Q5SWX8	454 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM167A	Q96KS9	214 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	DISC1	Q9NRI5	854 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	MSH4	O15457	936 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	C22orf31	O95567	290 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	VTN	P04004	478 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	LENG9	Q96B70	501 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC3	P53804	2025 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	NCOR1	O75376	2440 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	GJA10	Q969M2	543 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP7D2	Q96T17	732 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	OSMR	Q99650	979 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	TMX1	Q9H3N1	280 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	AKT3	Q9Y243	479 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR182	O15218	404 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	GRM6	O15303	877 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CLCN3	P51790	818 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	RIT2	Q99578	217 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	EVPL	Q92817	2033 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	MAGEB2	O15479	319 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CDKL5	O76039	1030 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	OAT	P04181	439 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	TMOD1	P28289	359 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	JAK3	P52333	1124 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	AIFM3	Q96NN9	605 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAM2	Q99965	735 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	TDP2	O95551	362 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SFN	P31947	248 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	GATM	P50440	423 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	PRKCE	Q02156	737 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CLDND1	Q9NY35	253 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	MUC3A	Q02505	3323 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	PLVAP	Q9BX97	442 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-208	ENST00000564966	MGEA5	O60502	916 aa		28.58	■■■□□ 2.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms