RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 LIG1P18858 919 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SP4Q02446 784 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 GRB10Q13322 594 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 STK38Q15208 465 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 GPT2Q8TD30 523 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 RGL1Q9NZL6 768 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 NFASCO94856 1347 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ELP1O95163 1332 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PPP6R2O75170 966 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ANK1P16157 1881 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 GRK4P32298 578 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF76P36508 570 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PRPHP41219 470 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PSMC6P62333 389 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 KRT85P78386 507 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 BEX3Q00994 111 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PPP2R5CQ13362 524 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 KIF22Q14807 665 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 RESP18Q5W5W9 173 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 MCTP2Q6DN12 878 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 RAET1EQ8TD07 263 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SCFD2Q8WU76 684 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SPATA32Q96LK8 384 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 GPR20Q99678 358 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 HPSEQ9Y251 543 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1B0GVL5 298 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ESPNB1AK53 854 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 TBX3O15119 743 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 STAM2O75886 525 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ATG7O95352 703 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PGK1P00558 417 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF286BP0CG31 522 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ACTR2P61160 394 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 CYP4A11Q02928 519 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 AFG1LQ8WV93 481 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 KAT2BQ92831 832 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF333Q96JL9 665 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PLIN2Q99541 437 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-211ENST00000561438 TRIP11Q15643 1979 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 GAS7O60861 476 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 GNRH1P01148 92 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 MMP3P08254 477 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 PFKFB1P16118 471 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 CASP1P29466 404 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 MCM4P33991 863 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFA8P51970 172 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 TNFAIP2Q03169 654 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 PDE4CQ08493 712 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 ARID5BQ14865 1188 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-211ENST00000561438 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms