RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556956.1

SLIRP-208, Transcript of SRA stem-loop interacting RNA binding protein, human

TSL 2

Gene SLIRP, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLIRP-208	ENST00000556956	PPP2R5D	Q14738	602 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NCAPH	Q15003	741 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PTPN14	Q15678	1187 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TNNI3K	Q59H18	835 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RTP2	Q5QGT7	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MZB1	Q8WU39	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RILPL2	Q969X0	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SAMD11	Q96NU1	681 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TRIM5	Q9C035	493 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SHPRH	Q149N8	1683 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GLI2	P10070	1586 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TET3	O43151	1660 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IFT172	Q9UG01	1749 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956		A0A1B0GTL3	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CHL1	O00533	1208 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CTAGE5	O15320	804 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CCP110	O43303	1012 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FIBP	O43427	364 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ATP8B1	O43520	1251 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IGSF3	O75054	1194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	EFEMP2	O95967	443 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CYBB	P04839	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CD3E	P07766	207 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HMOX1	P09601	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PDC	P20941	246 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MAPKAPK2	P49137	400 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GSDMD	P57764	484 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TGFB2	P61812	414 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TPM4	P67936	248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KRT85	P78386	507 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GPS2	Q13227	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	VPS53	Q5VIR6	699 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	VHLL	Q6RSH7	139 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CNTROB	Q8N137	903 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	JMJD8	Q96S16	334 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SPATA25	Q9BR10	227 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CDK19	Q9BWU1	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TNMD	Q9H2S6	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KCND1	Q9NSA2	647 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ELP1	O95163	1332 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956		A0A1W2PP64	1363 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	KIAA0232	Q92628	1395 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	ATP7A	Q04656	1500 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	ABCA6	Q8N139	1617 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	KIF1B	O60333	1816 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLIRP-208	ENST00000556956	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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