RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 PKP1Q13835 747 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ZNF365Q70YC5 407 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ANO5Q75V66 913 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 BRAPQ7Z569 592 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FAM167AQ96KS9 214 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CEP89Q96ST8 783 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 A0A087WWV3 80 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PP2D1A8MPX8 630 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SLITRK3O94933 977 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CHRNA1P02708 482 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 RSPH10BP0C881 870 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 NPEPPSP55786 919 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 XKR3Q5GH77 459 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TPH2Q8IWU9 490 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CLIC4Q9Y696 253 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 EYSQ5T1H1 3165 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PPC1 479 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CAND2O75155 1236 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CXCL10P02778 98 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 VTNP04004 478 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 GHRP10912 638 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CDC25AP30304 524 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 RFC2P35250 354 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 GRIN1Q05586 938 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 DRP2Q13474 957 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ECM1Q16610 540 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FAM26DQ5JW98 314 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 POTEGQ6S5H5 508 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 RPAINQ86UA6 219 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 C4orf19Q8IY42 314 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 METTL13Q8N6R0 699 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 NEK9Q8TD19 979 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 LRCH3Q96II8 777 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 COL4A6Q14031 1691 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ZBBXA8MT70 800 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LAD1O00515 517 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FGBP02675 491 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PFKMP08237 780 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PRPHP41219 470 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RASIP1Q5U651 963 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RSPH3Q86UC2 560 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms