RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB34Q9BZG1 259 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM260Q9NX78 707 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 LCTP09848 1927 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND3A2RUS2 1198 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM86B1E9PN63 330 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 MSH4O15457 936 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXA2O43364 376 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 IGFBP4P22692 258 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PTGS1P23219 599 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KLRC1P26715 233 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAPPC10P48553 1259 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHB4P54760 987 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMC5P62195 406 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PAK2Q13177 524 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PLCB4Q15147 1175 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 INF2Q27J81 1249 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 XKR3Q5GH77 459 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM26DQ5JW98 314 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 YME1L1Q96TA2 773 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 AAASQ9NRG9 546 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 AKT3Q9Y243 479 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FSD2A1L4K1 749 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BQV1 296 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 GJB5O95377 273 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP1P03956 469 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 OATP04181 439 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 SKIP12755 728 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCP20941 246 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM17P78536 824 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R5CQ13362 524 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CALCRLQ16602 461 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 TCP11Q8WWU5 503 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC5A5Q92911 643 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 DACT1Q9NYF0 836 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM186AA6NE01 2351 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1HO95180 2353 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 LAD1O00515 517 aa6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ASAP2O43150 1006 aa6.28□□□□□ -1.4
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