RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0U1RQJ8 604 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CETPP11597 493 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2A2P52657 109 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHA7Q15375 998 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 PFASO15067 1338 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PDHXO00330 501 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB39O15060 712 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MUTP22033 750 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK17Q00537 523 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TPH2Q8IWU9 490 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A27O95847 323 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT83P78385 493 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ELF2Q15723 593 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SFR1Q86XK3 245 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 DNERQ8NFT8 737 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 GPRASP2Q96D09 838 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MCM3APO60318 1980 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVK-9P63128 1117 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN18Q99952 460 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP25P42331 645 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 IWS1Q96ST2 819 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CARD6Q9BX69 1037 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNE2O96020 404 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 GAP43P17677 238 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HUNKP57058 714 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAM9Q13443 819 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 BANK1Q8NDB2 785 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 FGD4Q96M96 766 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PORCNQ9H237 461 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA3Q9UL41 463 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEB2H3BUK9 544 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CETN3O15182 167 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA2P16389 499 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP5P51878 434 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRX1Q86UT6 975 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 UBXN4Q92575 508 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE9A4FU28 777 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 NACC1Q96RE7 527 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 LXNQ9BS40 222 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MAFGO15525 162 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PGK2P07205 417 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EDNRBP24530 442 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBB2AQ13885 445 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 NEK11Q8NG66 645 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCC1Q9HA90 598 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PDXKO00764 312 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TADA3O75528 432 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 STAM2O75886 525 aa22.28■■□□□ 1.16
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