RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PANK4Q9NVE7 773 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 AMACRQ9UHK6 382 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TRAF5O00463 557 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NPTXRO95502 500 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GGPS1O95749 300 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PDE6BP35913 854 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PDIA5Q14554 519 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PARP6Q2NL67 630 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DUPD1Q68J44 220 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 HES6Q96HZ4 224 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CARD9Q9H257 536 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 VCXQ9H320 206 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 USP40Q9NVE5 1235 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TSPY2A6NKD2 308 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TTI1O43156 1089 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 UBOX5O94941 541 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GJB6O95452 261 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SOGA3Q5TF21 947 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 KRT79Q5XKE5 535 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RNF43Q68DV7 783 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DAAM2Q86T65 1068 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 MDM1Q8TC05 714 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RAD54LQ92698 747 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GANQ9H2C0 597 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NAGPAQ9UK23 515 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.74□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 MYMKA6NI61 221 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZPR1O75312 459 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CCNB1P14635 433 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SMARCA1P28370 1054 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PEX19P40855 299 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RASSF2P50749 326 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ACVR2BQ13705 512 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CNGA2Q16280 664 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ASRGL1Q7L266 308 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SPATA21Q7Z572 469 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 MXD3Q9BW11 206 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GOPCQ9HD26 462 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 LRRC42Q9Y546 428 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NCANO14594 1321 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.73□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RASGRF2O14827 1237 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CETN3O15182 167 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CHRNA3P32297 505 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FLT3P36888 993 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GRB10Q13322 594 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.72□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms