RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 RUBCNQ92622 972 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RABGGTAQ92696 567 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 BORCS6Q96GS4 357 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 DRC1Q96MC2 740 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 FIZ1Q96SL8 496 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PXMP2Q9NR77 195 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CDC23Q9UJX2 597 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CTAGE9A4FU28 777 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CXCL11O14625 94 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NR2F2P24468 414 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 STAT3P40763 770 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 VAV2P52735 878 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PSMC6P62333 389 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PPATQ06203 517 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SPP2Q13103 211 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MTMR1Q13613 665 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MTMR2Q13614 643 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SPA17Q15506 151 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PDXDC1Q6P996 788 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SFR1Q86XK3 245 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MNS1Q8NEH6 495 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TRIM58Q8NG06 486 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D5Q92609 795 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 DYDC2Q96IM9 177 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CCDC42Q96M95 316 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 WRNIP1Q96S55 665 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RMDN3Q96TC7 470 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 LXNQ9BS40 222 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GBP3Q9H0R5 595 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ACAD9Q9H845 621 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SPON1Q9HCB6 807 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RNF14Q9UBS8 474 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TSKSQ9UJT2 592 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 INTUQ9ULD6 942 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NFIBO00712 420 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TADA3O75528 432 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NR3C1P04150 777 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SERPING1P05155 500 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CCDC172P0C7W6 258 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ARP10275 920 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TGFB3P10600 412 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ALAS1P13196 640 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PLS3P13797 630 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 HOXD13P35453 343 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RARRES1P49788 294 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SNAP25P60880 206 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 FAM193AP78312 1265 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GTF2BQ00403 316 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 KCNMA1Q12791 1236 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 KIF5AQ12840 1032 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MAPK7Q13164 816 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 IER5LQ5T953 404 aa8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.28□□□□□ -1.08
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