RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-208	ENST00000526317	MGAT3	Q09327	533 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	REST	Q13127	1097 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PDIA5	Q14554	519 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	RASIP1	Q5U651	963 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	EVPL	Q92817	2033 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317		A0A087WWV3	80 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LAD1	O00515	517 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	MED24	O75448	989 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LYPLA2	O95372	231 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CTSH	P09668	335 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PRPH	P41219	470 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	NPEPPS	P55786	919 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	IER5	Q5VY09	327 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	METTL13	Q8N6R0	699 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LXN	Q9BS40	222 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ACTN1	P12814	892 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	RPA1	P27694	616 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	VTN	P04004	478 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TMOD1	P28289	359 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CLCN3	P51790	818 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	IKBKE	Q14164	716 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	LPIN1	Q14693	890 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ECM1	Q16610	540 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317		M0QZ92	97 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	GPR32	O75388	356 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	GHR	P10912	638 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	MUT	P22033	750 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CDC25A	P30304	524 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CSRP1-208	ENST00000526317	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53

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