RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 STX6O43752 255 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 NBNO60934 754 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 CTSHP09668 335 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 FOSL2P15408 326 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 THPOP40225 353 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 PSMC5P62195 406 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 CYP4A11Q02928 519 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 IL17AQ16552 155 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 ANO5Q75V66 913 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 RPAINQ86UA6 219 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 HSD17B14Q9BPX1 270 aa18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 10.1
HACE1-211ENST00000521962 CAND2O75155 1236 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 P4HBP07237 508 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 KLRC1P26715 233 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 TECP42680 631 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 MGAT3Q09327 533 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 PKP1Q13835 747 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 TCTN1Q2MV58 587 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 XKR3Q5GH77 459 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 TMEM240Q5SV17 173 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 RETREG2Q8NC44 543 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.52■□□□□ 0.56
HACE1-211ENST00000521962 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 SLITRK3O94933 977 aa18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 RFC2P35250 354 aa18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 FAM26DQ5JW98 314 aa18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 DEFB128Q7Z7B8 93 aa18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 PRDM6Q9NQX0 595 aa18.51■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 RSPH10B2B2RC85 870 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 LAD1O00515 517 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB39O15060 712 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 MED24O75448 989 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CHRNA1P02708 482 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CXCL10P02778 98 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 RSPH10BP0C881 870 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 DNAJB2P25686 324 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 PRPHP41219 470 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 RASIP1Q5U651 963 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 ZNF365Q70YC5 407 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 C4orf19Q8IY42 314 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 USP38Q8NB14 1042 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.5■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 LYPLA2O95372 231 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CLCN3P51790 818 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 NPEPPSP55786 919 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 GRIN2CQ14957 1233 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 MTERF2Q49AM1 385 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 NEK9Q8TD19 979 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.49■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 PP2D1A8MPX8 630 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 DRP2Q13474 957 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 TPH2Q8IWU9 490 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CLIC4Q9Y696 253 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.48■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 TET1Q8NFU7 2136 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 ARID2Q68CP9 1835 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 MYO9BQ13459 2157 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 PFKMP08237 780 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 PTPAQ15257 358 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 ECM1Q16610 540 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 POTEGQ6S5H5 508 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms