RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 BAIAP3O94812 1187 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CYP4A11Q02928 519 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 MBTPS1Q14703 1052 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 GPNMBQ14956 572 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 MTERF2Q49AM1 385 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 RASIP1Q5U651 963 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 C4orf19Q8IY42 314 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 ERMNQ8TAM6 284 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 RAB34Q9BZG1 259 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 POTEMA6NI47 508 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 EFCAB14O75071 495 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CHRNA1P02708 482 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 IKBKEQ14164 716 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SEPT8Q92599 483 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 MAP7D2Q96T17 732 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PPME1Q9Y570 386 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SCN5AQ14524 2016 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SLITRK3O94933 977 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 STBD1O95210 358 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 KCNJ6P48051 423 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 ANO5Q75V66 913 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 FERMT3Q86UX7 667 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 STK24Q9Y6E0 443 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM150BA6NC51 233 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 STX6O43752 255 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PRPHP41219 470 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 DNM2P50570 870 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 MGAT3Q09327 533 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 APBB2Q92870 758 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CEP170P1Q96L14 293 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 AKT3Q9Y243 479 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 LYPLA2O95372 231 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 GHRP10912 638 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CLCN3P51790 818 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PDIA5Q14554 519 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 XKR9Q5GH70 373 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 USP38Q8NB14 1042 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 LRCH3Q96II8 777 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 GINS2Q9Y248 185 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SQORQ9Y6N5 450 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 WDR81Q562E7 1941 aa20.02■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.02■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 BMP15O95972 392 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 CDC42EP1Q00587 391 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 LPIN1Q14693 890 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 GPR153Q6NV75 609 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 SLC9A7Q96T83 725 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR6Q9Y217 621 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 VTNP04004 478 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-215ENST00000514625 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms