RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513246.5

CANX-217, Transcript of calnexin, humanhuman

TSL 5

Gene CANX, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANX-217ENST00000513246 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.39■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 MYOGP15173 224 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 DEFB103AP81534 67 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 LPIN1Q14693 890 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TMX3Q96JJ7 454 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 BACH2Q9BYV9 841 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 MUC3AQ02505 3323 aa20.38■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 GHRP10912 638 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 MCM2P49736 904 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 IER5Q5VY09 327 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 NME8Q8N427 588 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 APBB2Q92870 758 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.37■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 EVPLQ92817 2033 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 EML1O00423 815 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 WNT7AO00755 349 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 USP38Q8NB14 1042 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.36■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 M0QZ92 97 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 STBD1O95210 358 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.851e-10■■■□□ 15.7
CANX-217ENST00000513246 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 SQORQ9Y6N5 450 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.35■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 MAGEB2O15479 319 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 NEMFO60524 1076 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 GJB5O95377 273 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 CA3P07451 260 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 XKR3Q5GH77 459 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 KIF28PB7ZC32 967 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 TLL1O43897 1013 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 MARCH6O60337 910 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 AMHP03971 560 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 PSMC5P62195 406 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 CALCRLQ16602 461 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 BANK1Q8NDB2 785 aa20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CANX-217ENST00000513246 REV3LO60673 3130 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 TRANK1O15050 2925 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 CLCN3P51790 818 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 EPHA7Q15375 998 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 METTL13Q8N6R0 699 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 MTMR9Q96QG7 549 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 CEP89Q96ST8 783 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 KIF3AQ9Y496 699 aa20.32■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 TMEM150BA6NC51 233 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 ARHGEF15O94989 841 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 CD52P31358 61 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 TAP1Q03518 808 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 RAD9AQ99638 391 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.31■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 LCHNA4D1U4 455 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 GPR32O75388 356 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 VTNP04004 478 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 ANO5Q75V66 913 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 TOP1MTQ969P6 601 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 MAP7D2Q96T17 732 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 PADI3Q9ULW8 664 aa20.3■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 COL4A6Q14031 1691 aa20.29■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.29■□□□□ 0.84
CANX-217ENST00000513246 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms