RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512916.2

HOXC13-AS-201, HOXC13 antisense RNA, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC13-AS, Length 1,408 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-AS-201ENST00000512916 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LPIN1Q14693 890 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NME8Q8N427 588 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 BANK1Q8NDB2 785 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ATP2B1P20020 1258 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CALCRLQ16602 461 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 APBB2Q92870 758 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NEMFO60524 1076 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GRIN2CQ14957 1233 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 METTL13Q8N6R0 699 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KIF3AQ9Y496 699 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 EVPLQ92817 2033 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KIF28PB7ZC32 967 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MAGEB2O15479 319 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 STBD1O95210 358 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CA3P07451 260 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PSMC5P62195 406 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 XKR3Q5GH77 459 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 COL6A3P12111 3177 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TMEM150BA6NC51 233 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TLL1O43897 1013 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 AMHP03971 560 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MCM7P33993 719 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 EPHA7Q15375 998 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MYLIPQ8WY64 445 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GINS2Q9Y248 185 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SQORQ9Y6N5 450 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GJB5O95377 273 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GJB2P29033 226 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CD52P31358 61 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TXKP42681 527 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CLCN3P51790 818 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MTERF2Q49AM1 385 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP38Q8NB14 1042 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MTMR9Q96QG7 549 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 VTNP04004 478 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TMOD1P28289 359 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZNF174Q15697 407 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KIZQ2M2Z5 673 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ANO5Q75V66 913 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 DYDC2Q96IM9 177 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CEP89Q96ST8 783 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 RAD9AQ99638 391 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LXNQ9BS40 222 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 RGL1Q9NZL6 768 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PADI3Q9ULW8 664 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 AKT3Q9Y243 479 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 LCHNA4D1U4 455 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ARHGEF15O94989 841 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PAK2Q13177 524 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TTC38Q5R3I4 469 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MAP7D2Q96T17 732 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms