RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 GCNT3O95395 438 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TCP10Q12799 353 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CUL1Q13616 776 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 BMT2Q1RMZ1 405 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP85LQ5SZL2 805 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.325e-10■■■□□ 15.1
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SH3BP2-221ENST00000511747 LY75O60449 1722 aa29.55■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 PEX26Q7Z412 305 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS36Q86VN1 386 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa29.55■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 H2AFVQ71UI9 128 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 LMBR1Q8WVP7 490 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 MSH4O15457 936 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SREBF1P36956 1147 aa29.54■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.54■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 SFI1A8K8P3 1242 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 HSD17B3P37058 310 aa29.54■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 MCTP2Q6DN12 878 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 EPN3Q9H201 632 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.322e-6■■■■■ 31.8
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SH3BP2-221ENST00000511747 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 STK24Q9Y6E0 443 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 F5H6K3 240 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 KRIT1O00522 736 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ERLIN2O94905 339 aa29.53■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 KLRC3Q07444 240 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO11Q86XK2 927 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RGL1Q9NZL6 768 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 VAV3Q9UKW4 847 aa29.53■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.52■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 TGFB1I1O43294 461 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R37O75864 691 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CRKP46108 304 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA6L10A6NI86 522 aa29.51■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 HSPA1LP34931 641 aa29.51■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 MDH1P40925 334 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC188H7C350 402 aa29.5■■■□□ 2.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 EP400Q96L91 3159 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 H0YGN5 161 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ICA1Q05084 483 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-221ENST00000511747 NT5DC3Q86UY8 548 aa29.5■■■□□ 2.31
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