RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493962.6

FBXO11-210, Transcript of F-box protein 11, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO11, Length 1,986 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO11-210ENST00000493962 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 PRR18Q8N4B5 295 aa5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 HHIPL1Q96JK4 782 aa5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.78□□□□□ -1.48
FBXO11-210ENST00000493962 SLC27A2O14975 620 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CYP17A1P05093 508 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 HALP42357 657 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 AK2P54819 239 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SEMA5AQ13591 1074 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 USP45Q70EL2 814 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TSPEARQ8WU66 669 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MVB12AQ96EY5 273 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 IPPQ9Y573 584 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.77□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 DGKIO75912 1065 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 EFEMP2O95967 443 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 HRGP04196 525 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CEACAM5P06731 702 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MSL3P1P0C860 447 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 THBS2P35442 1172 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 EPHA7Q15375 998 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 KCTD1Q719H9 257 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 FAM186BQ8IYM0 893 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PPM1EQ8WY54 764 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TBCBQ99426 244 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MAP3K14Q99558 947 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 B3GALT2O43825 422 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 UBXN7O94888 489 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 IGLV1-40P01703 118 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TACR1P25103 407 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 UGT8Q16880 541 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SGCZQ96LD1 299 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.76□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 H3BML4 177 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ACOT7O00154 380 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TGFB1P01137 390 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 NTRK1P04629 796 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MMEP08473 750 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SETSIPP0DME0 302 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 POF1BQ8WVV4 589 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TNIP3Q96KP6 325 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MYD88Q99836 296 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MYL10Q9BUA6 226 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CASS4Q9NQ75 786 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 DPP7Q9UHL4 492 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 L1RE1Q9UN81 338 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CELA3BP08861 270 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SDHAP31040 664 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 EPHA5P54756 1037 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MUM1Q2TAK8 710 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 NPNTQ6UXI9 565 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 DENND1CQ8IV53 801 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.75□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 CLCN7P51798 805 aa5.74□□□□□ -1.49
FBXO11-210ENST00000493962 MYBPC3Q14896 1274 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms