RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEF	A5A3E0	1075 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292		F8VZ95	297 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ORC4	O43929	436 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	UCHL3	P15374	230 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FGFR2	P21802	821 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PDE6C	P51160	858 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SNAP25	P60880	206 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CDK17	Q00537	523 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ITIH3	Q06033	890 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TATDN2	Q93075	761 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RAD23B	P54727	409 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	GNA14	O95837	355 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RUBCN	Q92622	972 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MTA3	Q9BTC8	594 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DNM3	Q9UQ16	869 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L15	C9J2P7	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L11	C9JVI0	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L18	D6R9N7	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L22	D6RA61	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L19	D6RCP7	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L20	D6RJB6	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ADCY8	P40145	1251 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KCTD1	Q719H9	257 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SFR1	Q86XK3	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C18orf8	Q96DM3	657 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	LAMA4	Q16363	1823 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CYTH3	O43739	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	EXOC3	O60645	756 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SPAG7	O75391	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DRD4	P21917	467 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TMED2	Q15363	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	LGR5	O75473	907 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BRAF	P15056	766 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DGKH	Q86XP1	1220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TPH2	Q8IWU9	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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