RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 ST5P78524 1137 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 GPR135Q8IZ08 494 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 D2HGDHQ8N465 521 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 Q9UFV3 132 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 SLC26A4O43511 780 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PYGMP11217 842 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CD83Q01151 205 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PTPRN2Q92932 1015 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 ZG16BQ96DA0 208 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 OR10A5Q9H207 317 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CEP72Q9P209 647 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CAPN14A8MX76 684 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 NAT1P18440 290 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 JAM2P57087 298 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 HGFACQ04756 655 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CRY1Q16526 586 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 KANK2Q63ZY3 851 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PRRX2Q99811 253 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 TINF2Q9BSI4 451 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 AMNQ9BXJ7 453 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CBLCQ9ULV8 474 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 ARVCFO00192 962 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 GUCY1A3Q02108 690 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 MOGSQ13724 837 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 MPIG6BO95866 241 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 PEX11BO96011 259 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 CRHR2Q13324 411 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF627Q7L945 461 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 CDC6Q99741 560 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 RAMP2O60895 175 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 RAB33AQ14088 237 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 AGAP2Q99490 1192 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 KCNK3O14649 394 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 MMEP08473 750 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 STAT5BP51692 787 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC66A2RUB6 948 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 TCF3P15923 654 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 DNM2P50570 870 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 RIN1Q13671 783 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1W2PRX2 142 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 GABREP78334 506 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SEC23AQ15436 765 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 PCSK4Q6UW60 755 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 ASB15Q8WXK1 588 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 RABGGTAQ92696 567 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 GMLQ99445 158 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 VWA7Q9Y334 891 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA4-211ENST00000490435 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ADCY3O60266 1144 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 MAP3K12Q12852 859 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 FAM209AQ5JX71 171 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SPATC1Q76KD6 591 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms