RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 DLL4Q9NR61 685 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB1Q9Y576 335 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD3Q9Y597 815 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ULK1O75385 1050 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 IL18BPO95998 194 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CD40P25942 277 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 PHC1P78364 1004 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 HTRA3P83110 453 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 KYQ8NBH2 561 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CROTQ9UKG9 612 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM2Q13029 1718 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CFTRP13569 1480 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKD3O94806 890 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN15O95858 294 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 PRLP01236 227 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 GUCY2FP51841 1108 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A3Q01959 620 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC32Q14392 662 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF124Q15973 351 aa4.5□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 STPG3Q8N7X2 389 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.5□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 MSRAQ9UJ68 235 aa4.5□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 RAB11FIP3O75154 756 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00310P59036 64 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 NME9Q86XW9 330 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf31Q8N865 590 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 KCND1Q9NSA2 647 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GTL3 188 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 DBX1A6NMT0 343 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ALG1L2C9J202 215 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 RFXAPO00287 272 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 APOL3O95236 402 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 RGS3P49796 1198 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 MTMR1Q13613 665 aa4.48□□□□□ -1.69
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