RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 VAV3Q9UKW4 847 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 C22orf31O95567 290 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 AMHP03971 560 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 PSMC5P62195 406 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 FBXO47Q5MNV8 452 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 GUCD1Q96NT3 240 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 NEMFO60524 1076 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TMOD1P28289 359 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 RABGGTBP53611 331 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 LPIN1Q14693 890 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 CALCRLQ16602 461 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 UGCGQ16739 394 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TCTN1Q2MV58 587 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 P4HBP07237 508 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 GHRP10912 638 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 QARSP47897 775 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 EPHA7Q15375 998 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 ODR4Q5SWX8 454 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB10Q96DT7 871 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 PCDHA12Q9UN75 941 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TLL1O43897 1013 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 GJB5O95377 273 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TRAPPC10P48553 1259 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 DEFB103AP81534 67 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 PPME1Q9Y570 386 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 EML1O00423 815 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 PPP2R2DQ66LE6 453 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 NOSTRINQ8IVI9 506 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 METTL13Q8N6R0 699 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 MAP7D2Q96T17 732 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 RAD9AQ99638 391 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 EFCAB12Q6NXP0 572 aa27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 OSBPL7Q9BZF2 842 aa27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD1-211ENST00000489379 CDC42EP1Q00587 391 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 SPIRE1Q08AE8 756 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 TMEM62Q0P6H9 643 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 GRIN2CQ14957 1233 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 C4orf19Q8IY42 314 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 BANK1Q8NDB2 785 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 NEK9Q8TD19 979 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 MTMR9Q96QG7 549 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 INSL6Q9Y581 213 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 TTC3P53804 2025 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 STBD1O95210 358 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 CA3P07451 260 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 MYOGP15173 224 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 NCAPH2Q6IBW4 605 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 MYOCDQ8IZQ8 938 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 TOP1MTQ969P6 601 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 MCM7P33993 719 aa27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 DNM2P50570 870 aa27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 PAK2Q13177 524 aa27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.3■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 ATP2B1P20020 1258 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 GJB2P29033 226 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 CD52P31358 61 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 TXKP42681 527 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 MTERF2Q49AM1 385 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 MYLIPQ8WY64 445 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 PADI3Q9ULW8 664 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 AKT3Q9Y243 479 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 GPR182O15218 404 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 FOSL2P15408 326 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 CLCN3P51790 818 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 TTC38Q5R3I4 469 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 ANO5Q75V66 913 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 CEP89Q96ST8 783 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-211ENST00000489379 LXNQ9BS40 222 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms