RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TPM1P09493 284 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 EDNRBP24530 442 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ICAM3P32942 547 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNJ6P48051 423 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 DNM2P50570 870 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF131P52739 623 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 UBXN1Q04323 297 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PADI6Q6TGC4 694 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 C4orf19Q8IY42 314 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP63Q96MT8 703 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MROH8Q9H579 483 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PARVGQ9HBI0 331 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ASTN1O14525 1302 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PQC6 194 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 OFD1O75665 1012 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GCNT3O95395 438 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GNA14O95837 355 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PSAPP07602 524 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MYBP10242 640 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RARRES1P49788 294 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CASP5P51878 434 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 KCTD2Q14681 263 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 UGCGQ16739 394 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MYCT1Q8N699 235 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP19Q99542 508 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TIPINQ9BVW5 301 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.46□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PDXKO00764 312 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MFAP3LO75121 409 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 HIP1RO75146 1068 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ERVK-9P63128 1117 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ERVK-24P63145 666 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 RBL2Q08999 1139 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPK7Q13164 816 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MAN2A1Q16706 1144 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CNGA4Q8IV77 575 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TC2NQ8N9U0 490 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC51Q96ER9 411 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 PANX2Q96RD6 677 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TMX1Q9H3N1 280 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 KCND1Q9NSA2 647 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.45□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SFI1A8K8P3 1242 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 PDHXO00330 501 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 BACH1O14867 736 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CETN3O15182 167 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TLR2O60603 784 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 GYPCP04921 128 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXD13P35453 343 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SOX10P56693 466 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ACTR2P61160 394 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CCNA1P78396 465 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SP3Q02447 781 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 Q3C1V9 767 aa11.44□□□□□ -0.58
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