RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 ACTR2P61160 394 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ADAM17P78536 824 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 KRT76Q01546 638 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 BANK1Q8NDB2 785 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 C8orf76Q96K31 380 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 FAM20AQ96MK3 541 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 KMT2EQ8IZD2 1858 aa17.99■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 EFCAB14O75071 495 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 PSMD10O75832 226 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 CCNE2O96020 404 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 FOXK2Q01167 660 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 NR5A1Q13285 461 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 IKBKEQ14164 716 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 INF2Q27J81 1249 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 TCEAL5Q5H9L2 206 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 IER5LQ5T953 404 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 RDM1Q8NG50 284 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 PCYT2Q99447 389 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ERAP1Q9NZ08 941 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 INSL6Q9Y581 213 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.98■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 DTNBO60941 627 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF286BP0CG31 522 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 COL19A1Q14993 1142 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 C7orf31Q8N865 590 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 NRCAMQ92823 1304 aa17.97■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 GFRA3O60609 400 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 TDP2O95551 362 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 CKBP12277 381 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 TRAPPC10P48553 1259 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 EPC2Q52LR7 807 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 RPAINQ86UA6 219 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 PRRX2Q99811 253 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 CLDND1Q9NY35 253 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
C1orf61-217ENST00000486517 GNAT1P11488 350 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SFNP31947 248 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 TCF15Q12870 199 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 PTK7Q13308 1070 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 LETM2Q2VYF4 491 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SERINC5Q86VE9 423 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 RNF135Q8IUD6 432 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 EDAQ92838 391 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SAMD11Q96NU1 681 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 CACNA1HO95180 2353 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 WDR64B1ANS9 1081 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 H3BNC9 293 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 CAND2O75155 1236 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 STAT5BP51692 787 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 GPM6BQ13491 265 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 AZI2Q9H6S1 392 aa17.94■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SLC37A4O43826 429 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SORBS3O60504 671 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 GAS7O60861 476 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 LTBRP36941 435 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 JAK3P52333 1124 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 PPP2R5CQ13362 524 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 HIC1Q14526 733 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 CLUL1Q15846 466 aa17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
C1orf61-217ENST00000486517 LRCH2Q5VUJ6 765 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms