RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAM17P78536 824 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 CD83Q01151 205 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 HOMER1Q86YM7 354 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 SCYL1Q96KG9 808 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 NR2E1Q9Y466 385 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0G2JNJ9 132 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 H7C1D1 291 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 MAP3K12Q12852 859 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 ICAM4Q14773 271 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 STILQ15468 1287 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 TCEA2Q15560 299 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF174Q15697 407 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 GNRHR2Q96P88 292 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 Q9UFV3 132 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF20P17024 532 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 SDSP20132 328 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP10-2P60368 255 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 KANK2Q63ZY3 851 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 E2F7Q96AV8 911 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-210ENST00000485459 ACSS2Q9NR19 701 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGGTB-210ENST00000485459 CBX4O00257 560 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP6O43182 974 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGGTB-210ENST00000485459 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 PCOLCEQ15113 449 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 AGBL4Q5VU57 503 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 USP30Q70CQ3 517 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 DNERQ8NFT8 737 aa6.13□□□□□ -1.43
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