RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484886.1

SNX17-206, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 2

Gene SNX17, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-206ENST00000484886 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 PBX2P40425 430 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 RABGGTBP53611 331 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 EPHA7Q15375 998 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 RAB30Q15771 203 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TCTN1Q2MV58 587 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 MTERF2Q49AM1 385 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 NME8Q8N427 588 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 PBX4Q9BYU1 374 aa21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 EVPLQ92817 2033 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TRAPPC10P48553 1259 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 CYP4A11Q02928 519 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 MGAT3Q09327 533 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TIFAQ96CG3 184 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 DYDC2Q96IM9 177 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 MAP7D2Q96T17 732 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 LXNQ9BS40 222 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 SIP14410 1827 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TMEM150BA6NC51 233 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 OR52Z1P0C646 297 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 TMOD1P28289 359 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 CLCN3P51790 818 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 CUL4AQ13619 759 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 NBR1Q14596 966 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 LPIN1Q14693 890 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 APBB2Q92870 758 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 MTMR9Q96QG7 549 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 RGL1Q9NZL6 768 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 AKT3Q9Y243 479 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX17-206ENST00000484886 GBF1Q92538 1859 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 VTNP04004 478 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 DEFB103AP81534 67 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TPH2Q8IWU9 490 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 POTEMA6NI47 508 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 SLC34A2O95436 690 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 AMHP03971 560 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 SCLT1Q96NL6 688 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 MYOGP15173 224 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 PDCP20941 246 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 CD52P31358 61 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TECP42680 631 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 PAK2Q13177 524 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 KIZQ2M2Z5 673 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 ANO5Q75V66 913 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 HSCBQ8IWL3 235 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 CEP170P1Q96L14 293 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.43■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TLL1O43897 1013 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 STBD1O95210 358 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 DNM2P50570 870 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 C4orf19Q8IY42 314 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 USP38Q8NB14 1042 aa21.42■■□□□ 1.02
SNX17-206ENST00000484886 NEK9Q8TD19 979 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms