RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	ATR	Q13535	2644 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CENPE	Q02224	2701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PDE8A	O60658	829 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GHRH	P01286	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ATP11A	P98196	1134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NFKB2	Q00653	900 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PMM1	Q92871	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	KIF2C	Q99661	725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GMIP	Q9P107	970 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	APC2	O95996	2303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785		H7C1W4	665 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785		J3QW42	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SUSD5	O60279	629 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	HTR3B	O95264	441 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PTPRA	P18433	802 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CLCN5	P51795	746 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GRAP	Q13588	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RNF180	Q86T96	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SI	P14410	1827 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	XDH	P47989	1333 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	AGRP	O00253	132 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GFRA2	O00451	464 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PLD2	O14939	933 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	BNIP3L	O60238	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CPE	P16870	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PPAT	Q06203	517 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DBN1	Q16643	649 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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