RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480940.1

PHF20-210, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-210ENST00000480940 TERF2Q15554 542 aa5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 C11orf74Q86VG3 221 aa5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PASD1Q8IV76 773 aa5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 FOXB1Q99853 325 aa5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SPATA25Q9BR10 227 aa5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 BTBD2Q9BX70 525 aa5.46□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 LCHNA4D1U4 455 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 BRINP1O60477 761 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TRIM13O60858 407 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PRLP01236 227 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CHGBP05060 677 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SLC6A3Q01959 620 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ADCY1Q08828 1119 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 GPR158Q5T848 1215 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 KANK2Q63ZY3 851 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 NME9Q86XW9 330 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SLC5A5Q92911 643 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 NUDT11Q96G61 164 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 GPATCH3Q96I76 525 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MAML3Q96JK9 1138 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SCYL1Q96KG9 808 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 OR10A5Q9H207 317 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.45□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 H0Y858 1186 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 GPR39O43194 453 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 KLHL18O94889 574 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CD40P25942 277 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 LSP1P33241 339 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 RGS3P49796 1198 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PHC1P78364 1004 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MYBPC3Q14896 1274 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 DDB1Q16531 1140 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TTC38Q5R3I4 469 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 BROXQ5VW32 411 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MCTP2Q6DN12 878 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ATL2Q8NHH9 583 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 E2F7Q96AV8 911 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.44□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CPEP16870 476 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TMPRSS15P98073 1019 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CD83Q01151 205 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ROM1Q03395 351 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PTPROQ16827 1216 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 SYT8Q8NBV8 401 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CALML6Q8TD86 181 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MYL10Q9BUA6 226 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 POFUT1Q9H488 388 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 VTA1Q9NP79 307 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MSRAQ9UJ68 235 aa5.43□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 NOBOXO60393 691 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ADCY8P40145 1251 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 RGL3Q3MIN7 710 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 RASSF3Q86WH2 238 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 C7orf31Q8N865 590 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 WDR48Q8TAF3 677 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MBD6Q96DN6 1003 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MCM8Q9UJA3 840 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.42□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 KDM1AO60341 852 aa5.41□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 ULK1O75385 1050 aa5.41□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PHF20-210ENST00000480940 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms