RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-208	ENST00000478932	SP2	Q02086	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	GHRHR	Q02643	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ARID5A	Q03989	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	KCNMA1	Q12791	1236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	GPR162	Q16538	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	SBF1	O95248	1867 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ASTN1	O14525	1302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZNF862	O60290	1169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	HIP1R	O75146	1068 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	KIF20A	O95235	890 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZBED6	P86452	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	MAPK7	Q13164	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TRIM14	Q14142	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ANO5	Q75V66	913 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CCDC51	Q96ER9	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ARID3A	Q99856	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	STK24	Q9Y6E0	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	PDXK	O00764	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	SLC26A4	O43511	780 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NOL4	O94818	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NR3C1	P04150	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	PGK2	P07205	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ACTN1	P12814	892 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	SLC9A1	P19634	815 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	FECH	P22830	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CYP2J2	P51589	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	OAZ1	P54368	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932		Q3C1V9	767 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-208	ENST00000478932	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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