RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	CXCL10	P02778	98 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MUT	P22033	750 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	KLRC1	P26715	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RPA1	P27694	616 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MGAT3	Q09327	533 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PKP1	Q13835	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PDIA5	Q14554	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	GPNMB	Q14956	572 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PTPA	Q15257	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IL17A	Q16552	155 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	NBN	O60934	754 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	BRD1	O95696	1058 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CTSH	P09668	335 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MTERF2	Q49AM1	385 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM240	Q5SV17	173 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TPH2	Q8IWU9	490 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	NME8	Q8N427	588 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CLIC4	Q9Y696	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZBTB39	O15060	712 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CHRNA1	P02708	482 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ACR	P10323	421 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RARRES1	P49788	294 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CLCN3	P51790	818 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	NPEPPS	P55786	919 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SHH	Q15465	462 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RASIP1	Q5U651	963 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	HERVK_113	Q902F9	699 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CEP170P1	Q96L14	293 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	AK8	Q96MA6	479 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SLC26A4	O43511	780 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TMOD1	P28289	359 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DDIT3	P35638	169 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RFC5	P40937	340 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ECM1	Q16610	540 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	HYI	Q5T013	277 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IER5	Q5VY09	327 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	KRT79	Q5XKE5	535 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF365	Q70YC5	407 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.59	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms