RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 TNFAIP2Q03169 654 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 COASYQ13057 564 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GLG1Q92896 1179 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 AP5Z1O43299 807 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SLC26A4O43511 780 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 RHOBTB3O94955 611 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 IGHA2P01877 340 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF286BP0CG31 522 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 STAT5BP51692 787 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 UNC13DQ70J99 1090 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 RDM1Q8NG50 284 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 HSPA6P17066 643 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PLCB2Q00722 1185 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 KIF22Q14807 665 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MTERF2Q49AM1 385 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CEP170P1Q96L14 293 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LYPLA2O95372 231 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 GH1P01241 217 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CHMP4BP1P59074 171 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MYL1P05976 194 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CASP5P51878 434 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 C1QTNF8P60827 252 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 KCNB1Q14721 858 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 SFR1Q86XK3 245 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 DAW1Q8N136 415 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 DYNC1I1O14576 645 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MUTP22033 750 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CNGA1P29973 690 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 EHHADHQ08426 723 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 NCAPHQ15003 741 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 KSR1Q8IVT5 923 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 RMND1Q9NWS8 449 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 HIP1RO75146 1068 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 BEX3Q00994 111 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LAMC2Q13753 1193 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MLKLQ8NB16 471 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 OATP04181 439 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MAPK7Q13164 816 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 AZI2Q9H6S1 392 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 SRRDQ9UH36 339 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 BECN2A8MW95 431 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LGALS2P05162 132 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 KCNA1Q09470 495 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 XKR3Q5GH77 459 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MYCT1Q8N699 235 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MYBP10242 640 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PLCB4Q15147 1175 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 TLK2Q86UE8 772 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 ADSSL1Q8N142 457 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PPTC7Q8NI37 304 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 NELFBQ8WX92 580 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FANCLQ9NW38 375 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MYADML2A6NDP7 307 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FKTNO75072 461 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LGR5O75473 907 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FAM13AO94988 1023 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 ATP1A3P13637 1013 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms