RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	DTNB	O60941	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PSMD10	O75832	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	TDP2	O95551	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PSAP	P07602	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	SCRN1	Q12765	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464		Q4G0T1	1027 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	RIT2	Q99578	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464		M0QZ92	97 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	CPLX1	O14810	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR32	O75388	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	STBD1	O95210	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PAK2	Q13177	524 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GPM6B	Q13491	265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GRM6	O15303	877 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PFKFB2	O60825	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GAS7	O60861	476 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	VTN	P04004	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	OAT	P04181	439 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	CTNNB1	P35222	781 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	BMPR1A	P36894	532 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GATM	P50440	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	CLCN3	P51790	818 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	ANAPC15	P60006	121 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	PRKCE	Q02156	737 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRF-211	ENST00000467464		C9IYK1	514 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC37A4	O43826	429 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	LARGE1	O95461	756 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	RB1	P06400	928 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	AK2	P54819	239 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	CAMK1	Q14012	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	DSC3	Q14574	896 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	OSMR	Q99650	979 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	CHMP2A	O43633	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	SFN	P31947	248 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	JAK3	P52333	1124 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	INF2	Q27J81	1249 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRF-211	ENST00000467464	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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