RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ACTN2P35609 894 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SLC16A2P36021 539 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CYP27A1Q02318 531 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PPFIA1Q13136 1202 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 KCNK18Q7Z418 384 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CAVIN3Q969G5 261 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CCDC102AQ96A19 550 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NACC1Q96RE7 527 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TIPINQ9BVW5 301 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MAF1Q9H063 256 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM107BQ9H098 131 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EPC1Q9H2F5 836 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RCCD1A6NED2 376 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 POTECB2RU33 542 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L15C9J2P7 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L11C9JVI0 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L18D6R9N7 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L22D6RA61 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L19D6RCP7 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L20D6RJB6 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZNF263O14978 683 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MED24O75448 989 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 POLR2MP0CAP2 368 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EPHX2P34913 555 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 KLK7P49862 253 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 STAT2P52630 851 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TNNC1P63316 161 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L24Q0WX57 530 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R5CQ13362 524 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R5AQ15172 486 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LRRC41Q15345 812 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DLGAP5Q15398 846 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PRR16Q569H4 304 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ARSHQ5FYA8 562 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM151AQ8WW52 585 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SPAG5Q96R06 1193 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 IWS1Q96ST2 819 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RIT2Q99578 217 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 STIM2Q9P246 746 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TMX2Q9Y320 296 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CCDC188H7C350 402 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MAPK13O15264 365 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 P4HA2O15460 535 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NOL4O94818 638 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NDUFB10O96000 172 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FDX1P10109 184 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 BCRP11274 1271 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 YY1P25490 414 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ABCD1P33897 745 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CETN1Q12798 172 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NFIAQ12857 509 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PAK2Q13177 524 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TNFAIP1Q13829 316 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EPHA7Q15375 998 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ECM1Q16610 540 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 C8orf74Q6P047 294 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MREGQ8N565 214 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 WHAMMQ8TF30 809 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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