RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 GCM1Q9NP62 436 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 E2F8A0AVK6 867 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NFIBO00712 420 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM253P0C7T8 217 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MC4RP32245 332 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHB3P54753 998 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGA1P56199 1179 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A3Q01959 620 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY2Q08462 1091 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FERMT2Q96AC1 680 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SGPP1Q9BX95 441 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 AMNQ9BXJ7 453 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 IRAK3Q9Y616 596 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM75PA6NK02 468 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MED14OSP0DP75 135 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAND1P57086 179 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NFATC3Q12968 1075 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MOGSQ13724 837 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 JDP2Q8WYK2 163 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ORAI2Q96SN7 254 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 OR10A5Q9H207 317 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 POFUT1Q9H488 388 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MTHFD2P13995 350 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ENPP1P22413 925 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K12Q12852 859 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAM9Q13443 819 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PDCD1Q15116 288 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 STILQ15468 1287 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MYL10Q9BUA6 226 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNK12Q9HB15 430 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO10Q9UK96 956 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 WASF3Q9UPY6 502 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 APOL3O95236 402 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MYBL2P10244 700 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RBP3P10745 1247 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CCND1P24385 295 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CAP1Q01518 475 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MESP2Q0VG99 397 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 UGT8Q16880 541 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RAX2Q96IS3 184 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC38A3Q99624 504 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MKS1Q9NXB0 559 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR3P46089 330 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 GLRBP48167 497 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MCL1Q07820 350 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MYBPC3Q14896 1274 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPN21Q16825 1174 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ANO3Q9BYT9 981 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KCND1Q9NSA2 647 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 EID1Q9Y6B2 187 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TNKSO95271 1327 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms