RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450217.2

TSSC2-201, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene TSSC2, Length 709 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC2-201ENST00000450217 NECAB1Q8N987 351 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 MBOAT7Q96N66 472 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 PADI3Q9ULW8 664 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 GINS2Q9Y248 185 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 OATP04181 439 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 LETM2Q2VYF4 491 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 METTL13Q8N6R0 699 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 RDM1Q8NG50 284 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 GTF3C6Q969F1 213 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 SAMD11Q96NU1 681 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 EYSQ5T1H1 3165 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 LARGE1O95461 756 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 PRKCEQ02156 737 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 MAGEB2O15479 319 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 ZNF862O60290 1169 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 UGCGQ16739 394 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 EPC2Q52LR7 807 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 NEK8Q86SG6 692 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 OXER1Q8TDS5 423 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 ASB2Q96Q27 587 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-201ENST00000450217 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 SLC37A4O43826 429 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 RPS6KA5O75582 802 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 FIBCD1Q8N539 461 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 VTNP04004 478 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 KRT2P35908 639 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 CLCN3P51790 818 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 KIZQ2M2Z5 673 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 ODR4Q5SWX8 454 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TMEM192Q8IY95 271 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 MAP7D2Q96T17 732 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TMX1Q9H3N1 280 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 COL4A6Q14031 1691 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 KAT6AQ92794 2004 aa20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 GPR182O15218 404 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 GPR32O75388 356 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TMOD1P28289 359 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 FAM20AQ96MK3 541 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 OSMRQ99650 979 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 AKT3Q9Y243 479 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 SIP14410 1827 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 H3BNC9 293 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 DGKIO75912 1065 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 STAG3L1P0CL83 205 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 AAK1Q2M2I8 961 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 XKR3Q5GH77 459 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 IL27Q8NEV9 243 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 COG5Q9UP83 839 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 JAK2O60674 1132 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TFF2Q03403 129 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 NR5A1Q13285 461 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 PPP2R5CQ13362 524 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 GPM6BQ13491 265 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-201ENST00000450217 PTPROQ16827 1216 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms