RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1C1P21283 382 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SEC24CP53992 1094 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VBP1P61758 197 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLFN5Q08AF3 891 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 COTL1Q14019 142 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35F6Q8N357 371 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 OSBP2Q969R2 916 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4Q9UBX2 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HPCAL4Q9UM19 191 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ASMTLO95671 621 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2C9P11712 490 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VAV1P15498 845 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ETV3P41162 512 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 APLP1P51693 650 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA3AQ14563 771 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PTPROQ16827 1216 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 UGP2Q16851 508 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ASB12Q8WXK4 309 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HPS1Q92902 700 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY6O43306 1168 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SSX5O60225 188 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF21O75509 655 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SASH3O75995 380 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ALOX5P09917 674 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PRKAR2BP31323 418 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R2P41236 205 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GNAI1P63096 354 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R2AP63151 447 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KRT24Q2M2I5 525 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TBATAQ96M53 351 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 OLFM1Q99784 485 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VANGL2Q9ULK5 521 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 L1RE1Q9UN81 338 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RASGRF2O14827 1237 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TSC22D2O75157 780 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF806P0C7X5 589 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GSTT2P0CG29 244 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GSTT2BP0CG30 244 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HNF1BP35680 557 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB10P48595 397 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 THOP1P52888 689 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PKP1Q13835 747 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ACAP1Q15027 740 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP14Q86UN6 197 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SNF8Q96H20 258 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CNDP1Q96KN2 507 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 EVPLLA8MZ36 301 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MTSS1O43312 755 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PFKFB2O60825 505 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1B1P15313 513 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN5P54829 565 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DEFA1P59665 94 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DEFA3P59666 94 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DSG1Q02413 1049 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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