RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPOQ9BU64 300 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB3Q9Y575 518 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SETSIPP0DME0 302 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL6BP14649 208 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RFC5P40937 340 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNAR2P48551 515 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGWQ7Z7B1 504 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ISCUQ9H1K1 167 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT7AO00755 349 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ASAP2O43150 1006 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FGFR2P21802 821 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA8P43361 318 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPT2Q15019 361 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NOX5Q96PH1 765 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RMI1Q9H9A7 625 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 STK36Q9NRP7 1315 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FOCADQ5VW36 1801 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 HIP1RO75146 1068 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TNNC1P63316 161 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NFIXQ14938 502 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ALX1Q15699 326 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LONP2Q86WA8 852 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 WASF1Q92558 559 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM23A6NLE4 172 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF174Q15697 407 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC38Q502W7 563 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GOPCQ9HD26 462 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PNMA3Q9UL41 463 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GPAA1O43292 621 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PALMO75781 387 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP10P09238 476 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC1A4P43007 532 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNG1P51959 295 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD23BP54727 409 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS2P61201 443 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 EHHADHQ08426 723 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP9Q9H5L6 903 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 OCEL1Q9H607 264 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LY9Q9HBG7 655 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF14Q9UBS8 474 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 COL4A1P02462 1669 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TLDC2A0PJX2 215 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB2P05120 415 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LDHCP07864 332 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NPR1P16066 1061 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GNAQP50148 359 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FBF1Q8TES7 1133 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KIFAP3Q92845 792 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms