RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCF2Q9UG63 623 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF536O15090 1300 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRYLO94915 3013 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP24Q9UPU5 2620 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATRXP46100 2492 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCHNA4D1U4 455 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PGK2P07205 417 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MECOMQ03112 1051 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASGRF1Q13972 1273 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARSHQ5FYA8 562 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFHC2Q5JST6 749 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LPIN2Q92539 896 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RUBCNLQ9H714 662 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPAMQ9HCL2 828 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRD7Q9NPI1 651 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTN3Q9P232 1028 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARVCFO00192 962 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APAF1O14727 1248 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBX3O15119 743 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GH2P01242 217 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASGR1P07306 291 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VSIG8P0DPA2 414 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKR1A1P14550 325 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCP2P22307 547 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SV2AQ7L0J3 742 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEX11Q8IYF3 940 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEX19Q8NA77 164 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PMEPA1Q969W9 287 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPHS2Q9NP85 383 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EREGO14944 169 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPAN6O43657 245 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BPNT1O95861 308 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTGS1P23219 599 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CASP2P42575 452 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ID4P47928 161 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC10P48553 1259 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP2B3Q16720 1220 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP120Q8N960 986 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF69Q9UC07 566 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ELP1O95163 1332 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPTBN2O15020 2390 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP250Q9BV73 2442 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms