RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALAS1P13196 640 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCG1P45844 678 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLRC3Q07444 240 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE4DQ08499 809 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERINC3Q13530 473 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NSMFQ6X4W1 530 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRNA1P02708 482 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CWH43Q9H720 699 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAMP2P13473 410 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP7A1P22680 504 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PFKPQ01813 784 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT17Q04695 432 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCSK4Q6UW60 755 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC32A1Q9H598 525 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HCSTQ9UBK5 93 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLUHO75153 1309 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLQO75417 2590 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCG2P13521 617 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPM1AP35813 382 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXCL12P48061 93 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP8B2P98198 1209 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C4orf17Q53FE4 359 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM9BQ9NQ34 198 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SATB1Q01826 763 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATMQ13315 3056 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LY6KQ17RY6 165 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF852Q6ZMS4 543 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPRG1Q6ZUI0 275 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHST3Q7LGC8 479 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGAT3Q09327 533 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP26C1Q6V0L0 522 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPTC7Q8NI37 304 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFHX3Q15911 3703 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYH4Q9Y623 1939 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LNP1A1A4G5 178 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WTAPQ15007 396 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL17BQ9UHF5 180 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IRAK3Q9Y616 596 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F5P12259 2224 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7ESF4 209 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXCL14O95715 111 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GORABQ5T7V8 394 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR5BQ86VZ2 330 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC28A2O43868 658 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP2D6P10635 497 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR12Q9ULL5 1215 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPFIA4O75335 1185 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXA6P31267 233 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GIT2Q14161 759 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KBTBD6Q86V97 674 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNRKQ9NRH2 765 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms