RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

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Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 NCOR1O75376 2440 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 HAS3O00219 553 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 BAIAP3O94812 1187 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 GH1P01241 217 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 CXCL10P02778 98 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 CKBP12277 381 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 RBL2Q08999 1139 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
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HOXD8-202ENST00000429017 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.65□□□□□ -1.18
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HOXD8-202ENST00000429017 IL27Q8NEV9 243 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
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HOXD8-202ENST00000429017 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD8-202ENST00000429017 RAD50Q92878 1312 aa7.65□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 B4E1Z4 1266 aa7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 SORBS3O60504 671 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 SELPP16109 830 aa7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 CAGE1Q8TC20 777 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ANKS1AQ92625 1134 aa7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 PLVAPQ9BX97 442 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 IL25Q9H293 177 aa7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.63□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ESR2Q92731 530 aa7.63□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 PXMP2Q9NR77 195 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.63□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF213O14771 459 aa7.63□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ADH6P28332 368 aa7.63□□□□□ -1.19
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HOXD8-202ENST00000429017 HSD17B4P51659 736 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ERVK-21P61565 698 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 PTK7Q13308 1070 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 DGKDQ16760 1214 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO11Q86XK2 927 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.63□□□□□ -1.19
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