RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNA1Q09470 495 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 CUL1Q13616 776 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPROQ16827 1216 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM20AQ96MK3 541 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 AMNQ9BXJ7 453 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 GCNT4Q9P109 453 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 SNAP25P60880 206 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP4A11Q02928 519 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 GJB7Q6PEY0 223 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 BORCS6Q96GS4 357 aa23.59■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 MSH4O15457 936 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 DOK7Q18PE1 504 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 MCTP2Q6DN12 878 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 H0YGN5 161 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 H2AFZP0C0S5 128 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 CIITAP33076 1130 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 HSD17B3P37058 310 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 H2AFVQ71UI9 128 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 NFS1Q9Y697 457 aa23.58■■□□□ 1.37
TMEM200B-201ENST00000420504 MMP14P50281 582 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 EPN3Q9H201 632 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 INTUQ9ULD6 942 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 STK24Q9Y6E0 443 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CLIC2O15247 247 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 TGFB1I1O43294 461 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 GCNT3O95395 438 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 POLD1P28340 1107 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PEX26Q7Z412 305 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP1R37O75864 691 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CACNB3P54284 484 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 VPS36Q86VN1 386 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 KAT2BQ92831 832 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 USP21Q9UK80 565 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC188H7C350 402 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 EYA4O95677 639 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 USH1GQ495M9 461 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 EML1O00423 815 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 OPLAHO14841 1288 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 ITGA4P13612 1032 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 MDH1P40925 334 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CRKP46108 304 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 NPEPPSP55786 919 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PTGISQ16647 500 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 FBXO11Q86XK2 927 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 F5H6K3 240 aa23.55■■□□□ 1.36
TMEM200B-201ENST00000420504 KRIT1O00522 736 aa23.55■■□□□ 1.36
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