RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 TSG101Q99816 390 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PANK4Q9NVE7 773 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 RGL1Q9NZL6 768 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 BTBD7Q9P203 1132 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.37□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 SAMM50Q9Y512 469 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TCHHQ07283 1943 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TPM2P07951 284 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FCER1AP12319 257 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GAP43P17677 238 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CYP11B2P19099 503 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 STK4Q13043 487 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 MOGSQ13724 837 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 RDM1Q8NG50 284 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 P2RX5Q93086 422 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 MED15Q96RN5 788 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 LXNQ9BS40 222 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MROH8Q9H579 483 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 THAP9Q9H5L6 903 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.36□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 MYH4Q9Y623 1939 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 WDR64B1ANS9 1081 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KCNJ18B7U540 433 aa7.35□□□□□ -1.23
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HDAC8-211ENST00000415409 CNMDO75829 334 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 LYPLA2O95372 231 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SMPD1P17405 629 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ERCC3P19447 782 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PTGS1P23219 599 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GJA5P36382 358 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PSMC6P62333 389 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCNA1P78396 465 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC63Q05C16 580 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EHHADHQ08426 723 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GIT2Q14161 759 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KCNJ12Q14500 433 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD2Q14681 263 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TREML4Q6UXN2 200 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 VSTM4Q8IW00 320 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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